Obdobie rokov 1993-1994
Rozdelením Československej federatívnej republiky a vytvorením samostatnej Slovenskej republiky ku dňu 1.januára 1993 vznikla Armáda Slovenskej republiky, ktorej organickou súčasťou bola i Vojenská polícia. Od tej doby sa píše i novodobá história Vojenskej polície Armády Slovenskej republiky.
Hlavní funkcionári boli: genmjr. Ing. Jiří EGG, plk. PaedDr. Rudolf VILČEK, mjr. Ing. Juraj LAUKO, pplk. Ing. Vladimír MARKO, pplk. Mgr. Ivan VAJDA, pplk. Ing. Karol TRELA, mjr. Ing. Štefan MORAVČÍK, plk. JUDr. Ján GEJDOŠ, plk. JUDr. Miloš SUKUBA.
Vznikom Vojenskej polície Armády Slovenskej republiky sa začali pripravovať legislatívne normy. Základnou z nich bol nový zákon o Vojenskej polícii, ktorý bol predložený do legislatívneho konania v marci roku 1993. Z procedurálnych, obsahových a iných dôvodov nebol predložený Národnej rade Slovenskej republiky. Prerokovaný bol až dňa 4.augusta 1994 výborom Národnej rady Slovenskej republiky pre petície, právnu ochranu a bezpečnosť a odporučil ho prerokovať schôdzi Národnej rady Slovenskej republiky. K prerokovaniu zákona nedošlo.
Dňom 1.septembra 1994 vznikol Generálny štáb Armády Slovenskej republiky. S jeho vznikom sa zmenila organizačná štruktúra vojsk, ako i Vojenskej polície.
Hlavní funkcionári boli: plk. doc. Ing. Libor GAŠPIERIK, CSc., genmjr. Ing. Jiří EGG, plk. JUDr. Miloš SUKUBA, pplk. Ing. Juraj POVAZSAI, pplk. Mgr. Ivan VAJDA, plk. JUDr. Ján GEJDOŠ, pplk. Ing. Vladimír MANCO, pplk. Ing. Vladimír MARKO, mjr. Ing. Štefan MORAVČÍK, pplk. Ing. Stanislav NEŠTICKÝ